Menggunakan Teknologi Komputer Baru Covid Mungkin Bisa Diidentifikasi Lebih Cepat

Menggunakan-Teknologi-Komputer-Baru-Covid-Mungkin-Bisa-Diidentifikasi-Lebih-Cepat

Berita Terbaru – Para ahli telah menentukan komponen dalam menjalankan pabrik mahkota Covid-19 yang dapat membantu para peneliti menemukan obat untuk infeksi, dan dengan cepat menguji apakah obat-obatan yang ada mungkin akan bekerja dengan adaptasi yang berubah saat dibuat.

Kelompok ini, didorong oleh University of Warwick sebagai komponen dari kelompok masyarakat EUTOPIA di perguruan tinggi Eropa, telah menciptakan kembali pengembangan di hampir 300 desain protein dari protein lonjakan infeksi Covid-19 menggunakan metode tampilan komputasi, dengan tujuan akhir untuk membantu mengenali yang menjanjikan target pengobatan. untuk infeksi.

Dalam makalah lain yang didistribusikan hari ini (19 Februari) di diary Scientific Reports, sekelompok fisikawan dan peneliti kehidupan merinci strategi yang mereka gunakan untuk menunjukkan kemampuan beradaptasi dan elemen dari masing-masing 287 struktur protein untuk infeksi Covid-19, atau disebut SARS. . – CoV-2, diakui sampai saat ini. Sama seperti entitas organik, infeksi terdiri dari protein, biomolekul besar yang melakukan kapasitas berbeda. Para peneliti menerima bahwa satu strategi untuk mengobati infeksi dapat mengganggu keserbagunaan protein ini.

Mereka telah membuat informasi, film dan data yang mendasarinya, menentukan bagaimana protein bergerak dan bagaimana mereka berubah bentuk, untuk setiap dari 287 struktur protein untuk Covid-19 dapat diakses pada jam pemeriksaan, terbuka secara terbuka untuk mengizinkan orang lain untuk meneliti kemungkinan jalan. untuk perawatan.

Para ilmuwan memusatkan perhatian pada upaya luar biasa pada bagian-bagian infeksi yang disebut protein lonjakan, juga disebut struktur area gema Covid-19, yang membentuk mahkota lengkap yang memberi nama Covid. Banjir ini adalah hal yang memungkinkan infeksi terhubung ke protein ACE2 dalam lapisan sel manusia, yang menyebabkan manifestasi Covid-19.

Protein lonjakan benar-benar homotrimer, atau tiga jenis protein serupa terkonsolidasi. Dengan menampilkan perkembangan protein dalam paku, para analis mengenali sistem ‘poros’ yang memungkinkan paku untuk berasosiasi dengan sel, seperti membuka jalur infeksi yang mungkin menjadi metode untuk menyebarkan kontaminasi ke jerat. sel. Para peneliti merekomendasikan bahwa dengan menemukan atom yang masuk akal untuk menghalangi komponen – dalam arti yang sebenarnya, dengan memasukkan ukuran dan bentuk sub-atom yang sesuai – peneliti obat sebenarnya ingin segera mengenali obat yang ada yang dapat memaksa melawan infeksi.

Pencipta utama Profesor Rudolf Roemer dari Departemen Fisika di Universitas Warwick, yang mengarahkan pemeriksaan saat sedang berlibur di CY Cergy-Paris Universit√©, mengatakan: “Menyadari cara kerja sistem ini adalah salah satu pendekatan untuk menghentikan infeksi, dan dalam penyelidikan kami kami adalah orang pertama yang melihat perkembangan bukaan secara detail. Sekarang setelah Anda mengetahui ruang lingkup gerakan ini, Anda dapat memilah apa yang dapat menghalanginya.

“Setiap individu yang tertarik untuk menganalisis apakah struktur protein pada infeksi dapat difokuskan pada pengobatan harus memiliki pilihan untuk melihat ini dan memeriksa apakah elemen yang kita hitung berguna untuk mereka.

“Kami tidak bisa melihat semua 287 protein bahkan dalam waktu yang tersedia. Orang harus memanfaatkan perkembangan yang kami lihat sebagai tahap awal untuk pengembangan target pengobatan mereka sendiri. Jika Anda menemukan pergerakan minat untuk struktur protein spesifik dalam informasi kami, Anda dapat menggunakannya. sebagai alasan untuk mendemonstrasikan atau penyelidikan eksplorasi lebih lanjut. “

Untuk menguji perkembangan protein, para peneliti menggunakan pendekatan tampilan adaptasi protein. Ini termasuk mengulangi struktur protein sebagai model PC lalu memeragakan kembali bagaimana konstruksi akan bergerak dengan menganggap protein sebagai bahan yang terbuat dari subunit tebal dan serbaguna, dengan kemungkinan perkembangan subunit ini ditentukan oleh ikatan sintetis. Strategi ini akhirnya menjadi mahir dan tepat ketika diterapkan pada protein yang sangat besar, misalnya, protein lonjakan Covid. Hal ini memungkinkan peneliti untuk segera mengenali fokus pengobatan yang menjanjikan untuk pemeriksaan tambahan.

Struktur protein yang menjadi dasar tampilan spesialis sepenuhnya terkandung dalam Bank Data Protein. Setiap orang yang mendistribusikan desain organik harus mengirimkannya ke basis informasi protein sehingga dapat diakses tanpa syarat dalam format standar untuk diunduh dan dipelajari oleh orang lain. Sejak awal pandemi Covid-19, para peneliti di seluruh planet telah mengirimkan sejumlah besar struktur protein dari protein terkait Covid-19 ke Protein Databank.

Profesor Roemer menambahkan: “Standar emas dalam pemodelan dinamika protein secara komputasi adalah metode yang disebut dinamika molekuler. Sayangnya, metode ini dapat memakan waktu sangat lama terutama untuk protein besar seperti lonjakan Covid-19, yang memiliki hampir 3000 residu – penyusun semua protein. Metode kami jauh lebih cepat, tetapi tentu saja kami harus membuat asumsi penyederhanaan yang lebih ketat. Meskipun demikian, kami dapat dengan cepat mensimulasikan struktur yang jauh lebih besar daripada yang dapat dilakukan metode alternatif.

“Saat ini, tidak ada yang menerbitkan eksperimen yang mengidentifikasi struktur kristal protein untuk varian baru Covid-19. Jika struktur baru muncul untuk mutasi virus, maka para ilmuwan dapat dengan cepat menguji pengobatan yang ada dan melihat apakah mekanisme baru telah berdampak pada efektivitas mereka menggunakan metode kami. “

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *

Related Post